Visualisation moléculaire 3D

  • Interface graphique facile à utiliser
  • Détection et analyse de sites actifs
  • Surfaces moléculaires et densité électronique
  • Visualisez les interactions non liées
  • Images et films de qualité publication
  • Graphiques stéréo 3D accélérés par GPU
  • Mixte Réalité Virtuelle et Impression 3D

Conception basée sur la structure

  • Interface épurée pour la conception de ligands
  • Détection et analyse de sites actifs
  • Conception de ligand interactive dans la poche
  • Diagrammes d'interaction protéine-ligand
  • Prédire les sites d'eau et l'énergétique
  • Amarrage à ajustement induit
  • Lier, développer et remplacer les fragments

Anticorps et Agents Biologiques

  • Ingénierie des protéines basée sur la structure
  • Évaluer les responsabilités et la dévelopabilité
  • Optimiser l'affinité, la stabilité et la solubilité
  • Modélisation à haut débit d'anticorps
  • Générer des bibliothèques virtuelles
  • Docking de protéines et cartographie d'épitopes
  • Modéliser les ADC et les protéines de fusion

MOEsaic - Explorateur SAR

  • Visualisation de SAR et SPR
  • Suggestions de composés de Wilson libre
  • Paires moléculaires appariées
  • Analyse et profilage du groupe R
  • Recherche de sous-structure et de similarité
  • Concevoir de nouveaux composés virtuels
  • Documenter les idées et partager les sessions

Conception basée sur les ligands

  • Génération et regroupement de conformations
  • Aligner et superposer de petites molécules
  • MOEsaic pour l'exploration SAR
  • Élucidation et criblage pharmacophoriques
  • Générer des modèles QSAR - Descripteurs MOE
  • Profils de torsion pour l'analyse des conformations
  • Énumération de bibliothèques combinatoires

Modélisation des protéines, de l'ADN/ARN

  • Visualiser les protéines, les patchs et les interfaces
  • Prédire la structure protéique 3D à partir de la séquence
  • Construire des modèles d'ADN/ARN
  • Explorer les mutations et les rotamères
  • Simulations de dynamique moléculaire
  • Recherche et échantillonnage de boucles/lieurs
  • Docking protéine-protéine

Criblage virtuel

  • Criblage pharmacophorique 3D
  • Contraintes de forme et de caractéristiques
  • Docking de petites molécules
  • Criblage d'empreintes digitales 2D et 3D
  • Remplacement de l'échafaudage et des fragments
  • Bases de données de conformation
  • Conception de bibliothèque basée sur la réaction

Découverte basée sur les fragments

  • Saut d'échafaudage
  • Liaison et croissance de fragments
  • Transformations en chimie médicinale
  • Énumération de bibliothèques combinatoires
  • Recherche multi-fragment
  • Hybridation de ligands (BREED)
  • Bibliothèques de fragments personnalisées

Bioinformatique structurale

  • Alignement de séquences et de structures multiples
  • Annoter les propriétés 3D sur les séquences
  • Créer et rechercher des bases de données de familles de protéines
  • Exploiter les données structurelles
  • Analyser les résidus conservés
  • Générer des arbres phylogénétiques groupés
  • Bases de données structurales d'anticorps et de TCR

Simulations moléculaires

  • Mécanique et dynamique moléculaires
  • Préparation automatisée de la structure
  • Calculs d'énergie libre
  • Alignement flexible de multiples molécules
  • Analyse conformationnelle – LowModeMD
  • Balayage et analyse de torsion
  • Spectres RMN, IR et VCD basés sur QM

Modélisation des peptides

  • Peptides macrocycliques et linéaires
  • Identifier les contacts peptide-protéine
  • Recherche conformationnelle
  • Énumérer les bibliothèques de peptides non naturels
  • Conception de peptides basée sur la structure
  • Optimiser les propriétés du peptide
  • Docking de peptides

Biologie structurale

  • Tracer les densités électroniques et les cartes de différences
  • Afficher les réseaux cristallins et les contacts
  • Prédiction des positions de l'eau
  • Docking guidé par la densité électronique
  • Créer des bases de données de familles de protéines alignées
  • Modélisation d'homologie pour le remplacement moléculaire
  • Vérification de la santé des structures protéiques

Chimio-informatique et QSAR

  • 400+ Descripteurs moléculaires 2D et 3D
  • Prédiction de pKa et génération de protomères
  • QSAR/QSPR linéaire
  • Classification bayésienne / Apprentissage automatique
  • MOEsaïque - Paires moléculaires correspondantes
  • Conception de bibliothèques combinatoires ciblées
  • Similarité chimique, diversité et regroupement

Personnalisation et déploiement

  • Ordinateur portable - Cluster - Cloud - Pipeline
  • Windows - Linux - macOS
  • Environnement de programmation intégré (SVL)
  • Intégration de logiciels tiers
  • Applications personnalisées et profils d'utilisateurs
  • Intégration Web, Services Web, API
  • Écouteur HTTP pour le contrôle à distance

PSILO® - Répertoire de structures protéiques

  • Dépôt conforme à RCSB
  • Interface de navigateur - Visualisation 3D
  • Curatage automatisé de la base de données de projet
  • Recherche et statistiques d'interactions 3D
  • Recherche de similarité de poche
  • Alignement de la structure protéique
  • Infrastructure informatique standard

ÉCOSYSTÈME D’ENTREPRISE

Chimistes médicinaux

Biologistes

Cristallographes

Chimistes computationnels

INTERFACES AVEC DES LOGICIELS TIERS

CSD - Mogul - Gold

Omega - ROCS - OEB Files

Amber Molecular Dynamics - TI

Quantum Mechanics

Pipeline Workflows

FlexX Docking

Molecular Dynamics

Quantum Mechanics

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Quantum Mechanics